中國農科院農業資源與農業區劃研究所設有中國農科院食用菌工程技術研究中心（部級中心）、農業部國家食用菌標準菌株庫、農業部食用菌區試組、農業部微生物肥料和食用菌菌種質量監督檢驗測試中心（雙認證）、中國農業微生物菌種保藏管理中心。
     專用主要設備設施有：隔氮式液氮凍存系統、無菌操作系統、多功能系統顯微鏡、高速冷凍離心機、梯度PCR儀、凝膠成像系統、低溫培養箱、人工氣候箱、菇房環境自控系統、蛋白質自動測定儀、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、原子熒光光度計、原子吸收光度計、脈沖電泳儀等。
     技術平臺有：國家食用菌產業技術研發中心，內設全國食用菌產業與技術的基礎數據庫；國家食用菌改良中心，種質評價和創新研究的系列設備設施；國家食用菌標準菌株庫，應用超低溫液氮保藏設施，保藏國內外優異種質1800多株，野生種質資源4000余株；農業部微生物肥料和食用菌菌種質量監督檢驗測試中心，負責全國食用菌菌種質量檢驗檢測；中國農科院食用菌工程技術研究中心，在不同生態區域下設產業化技術研發集成示范基地。

        “十五”以來承擔和完成的省級以上科技項目

      “十五”以來承擔和完成科技部平臺項目、科技部支撐項目、科技部“973”項目、科技部“863”項目、農業部國際農業先進技術引進項目、農業部公益性行業科研項目、農業部產業結構調整項目、農業部標準化項目、北京市科委重大和重點項目、天津市重點項目等33項。